现任国际烧伤协会东亚区代表，中华医学会烧伤外科学会候任主委，中国康复医学会、中国健康保健国际交流促进会以及中国生物材料学会三个一级学会的常委。吴军教授是中国烧伤康复学的创始人，组建了中国康复医学会烧伤治疗与康复专业委员会，建成了中国烧伤康复培训基地。主编了中国第一部 《烧伤康复治疗学》，牵头讨论并发布了第一部《中国烧伤康复指南》。创建了中国第一个以烧伤儿童为关注对象的“春苗烧伤儿童慈善基金会”，他组织的“烧伤儿童夏令营”在中国大陆属于首次，获得国内外机构组织的一致好评。